医院坚持内涵与外延并重，着力打造医院发展的学科、科研、管理、服务、信息化、保障等系列体系。形成了以七个中心（省乳腺疾病诊疗中心盐城分中心、新生儿疾病筛查中心、新生儿听力筛查中心、新生儿视力筛查中心、生殖医学中心、产前诊断中心、新生儿急救中心）为品牌、六个学科（妇科、产科、儿内科、儿外科、新生儿科、儿童保健与康复科）为支撑，三个基地为依托（国家级住院医师规范化培训基地协同医院、市儿科护理专科护士培训基地、市产科护理专科护士培训基地）、三个网络（市危重新生儿及婴儿转运网络、市妇幼健康服务联合体网络、市妇幼卫生信息平台网络）为优势、两个所（市妇幼保健所、市计划生育指导所）为平台的科学体系。